In den letzten Jahrzehnten hat das Pilgerwesen an Bedeutung stark zugenommen. Insbesondere ist dies am Pilgern auf dem europäischen Jakobsweg abzulesen. Wurden 1978 in Santiago de Compostela, Nordwestspanien, 13 ankommende PilgerInnen registriert, sind es 40 Jahre später rund 330‘000. Aus der Schweiz pilgern pro Jahr rund 1500 Leute zu Fuss nach Santiago.
Das Bistum St.Gallen wird von mehreren Pilgerwegen durchquert:

• Der Hauptweg des Jakobsweges führt herkommend aus Lindau oder Bregenz von Rorschach nach Rapperswil. Ein Zubringer führt von Rankweil über Appenzell nach St.Peterzell.
• Die Via Francisca führt von Konstanz via St.Gallen und das Rheintal über die Alpen nach Rom.
• Der Kolumbansweg kreuzt St.Gallen zwischen Irland und Bobbio in Italien.
• Der Gallusweg verbindet Irland mit Bregenz, Arbon und St.Gallen.
• Ein weiterer Pilgerweg im Bistum ist der ‚Felix-und-Regula-Weg‘, der vom Glarnerland aus vorbei am Kloster Berg Sion nach Zürich führt.

Auch Wallfahrten nach Lourdes sind im Bistum St.Gallen fest verankert. Das Pilgerbüro im Kloster Uznach organisiert jährliche Fahrten nach Lourdes.
Die Pilgerseelsorge im Bistum wird je nach Pfarrei anders gehandhabt. Stempel für den Pilgerpass und Hinweise für Pilger-Unterkünfte in Kirchen sind weit verbreitet. Vereinzelt liegen Gebete zum Segen auf den Weg oder spirituelle Impulse auf. In St.Gallen finden regionale Angebote wie Pilgergottesdienste oder die Feier des Jakobustages statt. In Santiago de Compostela hat sich 2009 eine deutschsprachige Pilgerseelsorge installiert. Sie richtet sich an ankommende Pilgerinnen und Pilger:
Ähnliche Einrichtungen kennen Einsiedeln, Rom, Jerusalem, Assisi und Lourdes.

Seit 2025 ist bei der Cityseelsorge St.Gallen ein Pilgerseelsorger für die Stadt und Region St.Gallen tätig.